町の人々から頼られる錬金術士だったソフィーのおばあちゃん。その若かりし頃の衣装をソフィーが
発見したことをきっかけに、立派な祖母に近づこうと奮闘するエピソードがストーリー本編と並行して描かれます。
-
ソフィーは日ごろの御礼にとモニカとコルネリアをお茶会に誘っておばあちゃんのレシピを使ったお菓子作りに挑戦。 -
プラフタやおばあちゃんとの錬金術士としての差に悩むソフィー。そんな時、おばあちゃんの言葉から常識を打ちやぶるアイデアを思いつく。
-
掃除が大の苦手なソフィー。幼なじみのモニカに成長したところを見せるために調合後に散らかりきった部屋を自分で解決しようとするが… -
モニカに成長したところを見せたいソフィー、ソフィーの成長を見たいモニカは共に依頼を受けて魔物退治へ出発！
他にもさまざまなエピソードを収録！
- ◆コスチューム（6種類）
- ドールメイク新ボディ：
「アクアスーツ」、「レイディセイバー」、
「シルヴァテイル」、「ヴィオラージュ」、「セイントナイツ」、
「マスコッティ」 - ◆BGMパック（4種類）
- 「アトリエシリーズスペシャル」、「週刊ファミ通特典アレンジ」、
「電撃PlayStation特典アレンジ」、「ガストスペシャル」 - ◆アイテムセット（2種類）
- 「ソフィーのアトリエ アイテム5種セット」、
「ガスト公式特典厳選アイテムパック」 - ◆イベント（1種類）
- 「後日談エピソード」
- ◆マップ（1種類）
- 追加採取地「隠されし書架」
- ◆機能拡張（1種類）
- 新難易度「DESPAIR」の追加
スタミナ消費減や自動採取や高速移動など、さまざまな特色を持つ４つの新しい乗り物や探索道具がシナリオ進行に応じ
追加され、より便利に探索を行えます。また、強力なボス「パルミラ」を悩ませる７体の新モンスターの討伐クエストが
追加され、７体を討伐するとさらに強化された「パルミラ」に挑むことができます。
-
燃料となるアイテムを使用して、通常より速く移動できるほか、コンテナ内にあるアイテムを装備できるようになります。また、LP消費を抑えたり、移動中にHP・MPが回復するようになります。 -
乗り心地がよさそうだと喜ぶリアーネ。ただ、フィリスによると車体の中に欠点があるそうで…。
-
フィリスの探索をサポートし、マップの踏破率を上昇しやすくしてくれます。付与する効果によって悪天候時のデメリットを解消したり、カゴの容量を増やすこともできます。 -
「プニプニ！」と鳴くプニドローン。その可愛らしい見た目に、リアーネは何を食べさせるか思案を始めるが…
-
燃料となるアイテムを使用して、通常より速く移動できるほか、ボタンを押している間は自動的に採取が可能です。また、搭乗中に敵から襲われなくなったり、採取でより高品質な材料が取れます。
-
材料を根こそぎ採り尽くせる、錬金術士垂涎の一品だと得意げなフィリス。一方、リアーネは周辺の材料がなくなってしまわないか不安に…
-
水中で必要となるエアドロップの消費が早くなる代わりに、水中を通常より早く移動できます。またLP消費を抑えることもできます。 -
便利な乗り物が出来たと得意げなフィリスだが、ドロップシップは一人乗りだとリアーネが指摘。フィリスが打ち出した解決策とは……？
-
各所に現われた魔物のせいで、パルミラの力が封じられてしまったらしい。元気のないパルミラの代わりに、フィリスは魔物退治を引き受ける。 -
すべてを退治して報告に行くと、元気になったパルミラに会える。前より強くなったフィリスたちなら本気に近い力を出したいと、パルミラに気合いが入る。
- ◆キャラクター（2名）
- 「シャノン」「ハインツ」
- ◆コスチューム（16着）
-
- フィリス追加衣装：
- 「ナイトレスセイバー」、「青き響きの学生服」、
「リゾートバケーション」、「ワンダーランド」
- 軽装シリーズ：
- フィリス「リチュアルクレリック」、
リアーネ「ブレイブアーチャー」、
イルメリア「ノーブルウィザード」、
ドロッセル「デュエルウォーリア」、
ソフィー「グロリアスセイジ」、
シャノン「クレストパラディン」
- 水着シリーズ：
- フィリス「空色パピヨン」、
リアーネ「夜のオニキス」、
イルメリア「紅白アムール」、
ドロッセル「新緑のフォイユ」
ソフィー「情熱のソレイユ」、
シャノン「桃色フレーズ」
- ◆BGMパック（4種類）
- 「アトリエシリーズスペシャル」、「週刊ファミ通特典アレンジ」、
「電撃PlayStation特典アレンジ」、「ガスト歴代タイトル」」 - ◆マップ（2種類）
- 新たな採取地「聖地ベスティエ」、「リーゼントレーネ」
『ネルケと伝説の錬金術士たち』の世界につながる絵画が追加され、中で領主「ネルケ」を手助けし街を発展させるための
シナリオやボス戦が展開します。「ネルケの世界」へはオリジナル版の絵画世界に追加された宝箱から「不思議な絵画の
断片」を集めることで入れるようになります。
-
ネルケから「グランツヴァイトの樹」の実が甘美だと聞かされたリディーとスールは、樹の実欲しさに街の発展を手伝うことに…… -
ネルケから依頼された品を調合した双子。意気揚々と報告に行く。
-
「グランツヴァイトの樹」に突如、強大な魔物が出現。 -
ネルケが大切にしている街を守るため、リディーとスールは決死の覚悟を決める。
-
ネルケの世界にある街「ヴェストバルト」。特徴的な建物が並び、明るく賑やかな印象だ。 -
大きなぷにの形をした建物。その不思議な見た目に、リディーとスールも興味津々。
-
ハートの形をしたパイの専門店。様々なパイが並ぶショーウィンドウを前に、どれを食べようか思案している様子。 -
独特なセンスで描かれた絵画が飾られた建物。絵画を前にして、リディーはなぜか誇らしげだが……？
-
街外れにある農場には、巨大なタルが。中にはジュースがたっぷりと詰まっていて、街の人々に振舞われているのだとか。 -
街のシンボルともいえる「グランツヴァイトの樹」。この世界において、とても重要な役割を担っているようだ。
- ◆キャラクター（2名）
- 「ルーシャ」「イルメリア」
- ◆コスチューム（7着）
- リディー&スール「マリー&エリーなりきりコスチューム」、
リディー「スマート&スイート」、スール「アクティブ☆ラブリー」、
ソフィー「ベストパートナー」、フィリス「先生のお気に入り」、
ルーシャ「うさぎのしっぽ」、イルメリア「コルメリア？」 - ◆BGMパック（5種類）
-
「アトリエシリーズスペシャル」、「電撃PlayStation特典アレンジ」、
「BLUE REFLECTION」 、「ガスト歴代タイトル」、「よるのないくに2」 - ◆アイテムセット（5種類）
- 「プレミアムボックス特選アイテムセット」、
週刊ファミ通「役立つアイテムのセット」
「新天地大冒険セット第1弾」、「新天地大冒険セット第２弾」、
「名品珍品アイテムパック」 - ◆マップ（1種類）
- 「フィリスのアトリエ クラーデル平原」
- ◆その他DLC（5種類）
-
- レシピ：
- 「秘伝調合研究ノート」、「探求者たちの口伝集」
- クエスト：
- 「経験値どっさりクエスト」、「お金がっぽしクエスト」
- バトルミックス：
- 「バトルミックスの極意」
- ◆機能拡張（8種類）
- 「レアアイテム商人追加」、「小型イベント追加」、
「フォルギオル再戦追加」、「ソフィー先生の腕試し」、
「アイテム特性追加」、「プレイヤーレベル上限解放」、
「プレイヤーキャラクタースキル追加」、「パルミラ、テルミナ上限解放」
- 「フォトモード」ではフィールド上でゲームを一時停止して撮影が行えます。パーティメンバーからサブキャラクターや敵まで自由に配置し、時間帯や天候やフィルターを調整して個性豊かな写真をお楽しみください。
- 「デジタルアートブック」では各作品のイラストやBGMをお楽しみいただけます。
雑誌用やショップ特典用の限定描き下ろしイラストなど、入手しづらかった作品もご覧いただけます。 
※「デジタルアートブック」は購入特典：「不思議DX デジタルアートブック」ダウンロードシリアルをご使用後に利用できます。
